Cet anticorps reconnaît une protéine de 38kDa, identifiée comme étant la synaptophysine. Il marque les cellules neuroendocrines normales de la médullosurrénale humaine, du corps carotidien, de la peau, de l'hypophyse, de la thyroïde, du poumon, du pancréas, de la muqueuse gastro-intestinale, des cellules de Paneth dans le tractus gastro-intestinal et des cellules pariétales gastriques. Les neurones du cerveau, de la moelle épinière et de la rétine sont également marqués. En combinaison avec l'anti-chromogranine A et l'anti-NSE, l'Ab à la synaptophysine est très utile pour l'identification des cellules neuroendocrines normales et des néoplasmes neuroendocriniens.