Este anticuerpo reconoce una proteína de 38kDa, identificada como sinaptofisina. Marca las células neuroendocrinas normales de la médula suprarrenal humana, el cuerpo carotídeo, la piel, la glándula pituitaria, la tiroides, el pulmón, el páncreas, la mucosa gastrointestinal, las células de Paneth del tracto gastrointestinal y las células parietales gástricas. También se marcan las neuronas del cerebro, la médula espinal y la retina. En combinación con anticromogranina A y anti-NSE, el Ab a sinaptofisina es muy útil en la identificación de células neuroendocrinas normales y neoplasias neuroendocrinas.